Истинные гены, кодирующие белки*. По современным оценкам в геноме человека всего около 26 тысяч структурных генов. Возможно, что в действительности их больше, но они не поддаются быстрой идентификации по разным причинам. Во-первых, они могут экспрессироваться на очень низком уровне или в ограниченных типах клеток (тогда их трудно заполучить в кДНКовые библиотеки). Во-вторых, они могут быть атипичными и не узнаются компьютером с помощью определённых алгоритмов. В-третьих, могут быть пропущены очень большие по размеру гены, содержащие маленькие экзоны. В-четвёртых, малые гены могут быть “спрятаны” внутри интронов генов большого размера. Поэтому создание полного и точного каталога генов человека может потребовать много времени и усилий. Следует отметить, что белок-кодирующие гены в процессе эволюции изменяются медленнее, чем окружающие их некодирующие области генома, и всё же, геном, достающийся новому поколению организмов, каждый раз “переиздаётся” с недоделками, переделками и изменениями (см. также Принцип “дополнительности”).
*Иногда к структурным генам относят и гены, кодирующие РНК. В то же время структурные гены как бы противопоставляются регуляторным генам.