От лат. calculus (calculi) – мелкие камешки, галька. Камни (конкременты) во внутренних органах – почках, желчном и мочевом пузыре.
Римское calx первоначально обозначало все “мягкие” камни, в противоположность silex – твёрдый камень, а затем закрепилось только за карбонатом кальция в виде известняка и мрамора.
*Также камешки для счёта (вспомните, калькулятор, калькуляция – вычисление).