1. Метод регистрации метаболитов, позволяющий идентифицировать ключевые ферменты и гены, ответственные за метаболизм. Целью метода является получение “мгновенной фотографии” метаболических сетей, что позволяет, например, предвидеть возможное образование токсических соединений при приёме лекарственных препаратов. На метаболический профиль организма сильно влияют кишечные бактерии, их количество и состав (см. Микробиом).
2. Этот метод также является основой современной селекции генетически модифицированных организмов (бактерий и растений).