”. Русский перевод с английского названия метода секвенирования ДНК shot-gun (shotgun – дробовик). Метод секвенирования генома в виде случайно образованных фрагментов ДНК*. Название метода возникло из-за того, что ДНК предварительно дробится с помощью рестриктаз на множество фрагментов (кусочков), как будто в геном выстрелили из дробовика. В основе метода лежит принцип восстановления секвенированой последовательности (большой вставки в BAC- или PAC-векторе), “клон за клоном”, которую предварительно разрезают на более короткие случайные фрагменты (по 1–2 тыс. п. н.). Эти фрагменты затем секвенируют по отдельности и полученные данные вводят в компьютер, который с помощью специальных алгоритмов ищет перекрывающиеся последовательности и восстанавливает исходную последовательность. В рамках проекта “Геном человека” (HGP) использовали “иерархический метод дробовика”, а также “метод полногеномного дробовика”. Последним методом воспользовалась частная биотехнологическая компания “Celera Genomics”, не проводившая предварительного картирования генома, как это сделали исследователи из Международного Консорциума под руководством Френсиса Коллинза (см. Проект “Геном человека”, Контиги). Синонимы – метод случайного разрезания генома рестриктазами, англ. shot-gun experiment, shot-gun sequencing method (русский эквивалент – шотган-секвенирование).
*Техника была предложена в 1977 г. английским биохимиком, лауреатом двух Нобелевских премий (1958 и 1980 гг.), Фридериком Сенгером (F. Sanger).