От греч. pathos – болезнь, страдание, genan – порождать и лат. opportunus – легко подвергающийся чему-либо. Микроорганизмы, которые редко вызывают заболевания или не вызывают их вообще у людей с нормально функционирующей иммунной системой, но использующие возможность при ослаблении защитных сил организма. Другими словами, микроорганизмы, обычно не являющиеся патогенными, но при ослаблении защитных сил организма, проявляющие патогенность. Такие патогены обычно представляют собой компоненты нормальной микрофлоры (микробиоты) человека. Они могут также вызывать заболевания при попадании в нехарактерные для них анатомические области организма. Например, дрожжеподобный грибок Candida albicans, обитающий на коже, при попадании в кровоток, может вызвать эндокардит, а зеленящие стрептококки (S. sanguis и S. mutans), обычные обитатели полости рта – частая причина подострого эндокардита. В эту же группу можно отнести бактерии родов Abiotrophia, Acinetobacter, Alcaligenes, Bifidobacterium, Cardobacterium, Citrobacter, и ряд др. Оппортунистические инфекции становятся серьёзной проблемой при приобретённом иммунодефиците (СПИДе).
