Англ. Lk. Величина, характеризующая спирализацию кольцевой (замкнутой) молекулы ДНК и выражающаяся значением N/γ0, где N – число пар оснований в ДНК, а γ0 – число пар оснований, приходящихся на один виток двойной спирали в линейной ДНК, находящейся в тех же условиях.
“Посадочные площадки”. В стерической структуре многих регуляторных белков-киназ*, транскрипционных факторов и адаптерных белков обнаружены специальные сайты для связывания с нужными молекулами – “посадочные площадки” (от англ. docking grooves, где docking – производить стыковку, ставить в док, т. е. на место и grooves – канавка, желобок, прорез, паз). Например, белки AKAP, удерживая каталитические и регуляторные субъединицы PKA вблизи определённых структур клетки, выступают в роли бивалентных или многовалентных поддерживающих каркасов (скэффолдов), создающих оптимальные локальные условия для протекания ферментативных реакций (см. Адаптерные белки, Гравин). Понимание процессов докинга абсолютно необходимо для поиска и создания новых лекарственных средств, специфически связывающихся со своими мишенями, включая также и докинг различных лигандов со своими рецепторами.
*В частности, ERKs, JNK и p38.
