Процесс эволюционного расхождения популяций одного вида, в результате которого из исходного вида образуются новые виды. Другими словами, эволюционный процесс образования новых видов из уже существующих. Считается, что основной механизм видообразования – репродуктивная изоляция, возникающая по разным причинам. В результате изоляции у двух территориально разделённых групп организмов накапливаются серьёзные изменения, препятствующие оплодотворению или приводящие к рождению мёртвых, а также бесплодных потомков (лошак и мул). Исследования, проведённые на дрозофилах, показали, что скачки генов из одной хромосомы в другую (так называемые “блуждающие, или прыгающие гены”) также могут приводить к появлению новых видов. Так у двух разных видов дрозофил (Drosophila melanogaster* и Drosophila simulans) один и тот же ген JYAlpha, отвечающий за нейтрализацию спермы, находится на разных хромосомах (четвёртой и третьей, соответственно). Этот факт показывает, что репродуктивная изоляция может начаться и без изменения функций генов. На мышах также показано, что мутация только в одном гене может приводить к видовому расхождению, поскольку мутанты уже не скрещиваются с особями дикого типа.
Согласно классическим представлениям Ч. Дарвина: “разновидность есть зачинающийся вид, вид – обособившаяся, определившаяся разновидность”.
*Название переводится как “любительница нектара чернобрюшковая”. В ранних генетических исследованиях плодовая мушка называлась Drosophila ampelophila, где лат. “ampelophila” означает “любительница винограда”.