От греч. endon – внутри, genan – порождать. Ретровирусы, присущие геному человека (human endogenous retroviruses), и приобретённые вследствие инфекций, происходивших в процессе эволюции у далёких предков человека (больше 25 млн. лет назад) или затронувших уже самого человека (после разделения ∼6 млн. лет назад линий шимпанзе и человека). Долгое время эндогенные вирусы рассматривались как генетические паразиты, или как генетический “мусор”, представляющий собой в большинстве случаев неактивные продукты мутационной деградации, но сейчас мы уже знаем, что определённые гены эндогенных вирусов могут экспрессироваться в клетках некоторых тканей и сохраняются отбором. Экспериментально показано, что белки трёх генов вирусного происхождения Syncytin1, Syncytin2 и EnvPb1 способны инициировать слияние клеток в ходе формирования плаценты** (см. Синцитиальный трофобласт). Эндогенные вирусы также называют эндогенными ретровирусами (см. Эндогенные ретровирусы (ЭРВ)).
*Поскольку определённых генов вирусных оболочек нет у лемуров, но они есть у обезьян Старого и Нового Света, то исходные вирусы могли проникнуть и “прижиться” в геномах наших предков ещё раньше (больше 43 млн. лет назад), т. е. после разделения обезьян и лемуров.
**Эти белки экспрессируются в развивающейся плаценте. Предполагают, что они могут также защищать эмбрион от иммунной системы матери, поскольку в них содержится участок, обладающий иммунносупрессивным действием. Наконец, белки вирусных оболочек, например, такие как ENVV1, ENVV2 (от англ. envelope – оболочка, обёртка и virus) могут занимать и блокировать поверхностные рецепторы клеток, к которым прикрепляются “дикие” ретровирусы, что, естественно, препятствует проникновению вирусов в клетки, и защищает организм от инфекции.